#наука — Public Fediverse posts

Programmable design of synthetic plant immune receptors for pathogen protein recognition | Science
Исследователи разработали подход, позволяющий конструировать искусственные иммунные рецепторы для растений, которые могут распознавать любые заданные белки патогенов: вирусов, бактерий и грибов. В основе искусственного рецептора лежит растительный рецептор Pikm-1, в котором только заменяют «распознающий модуль» на специально спроектированный пептидный фрагмент. Этот фрагмент создают с помощью искусственного интеллекта, используя AlphaFold, BindCraft и другие инструменты, чтобы получить структуру, которая будет связывать целевой патоген. А для того, чтобы получить более эффективные рецепторы, использовали метод направленной эволюции белков внутри растительных клеток (GRAPE-based evolution). В растительную клетку вводили ген синтетического рецептора, встроенный в конструкцию на основе геминивируса. При репликации конструкции появлялись тысячи копий гена за короткое время, и при этом в них возникали случайные мутации — так получали огромную библиотеку вариантов рецептора прямо внутри клетки. И среди них, отбирали лучшие, например под действием патогена. Таким образом, по мнению авторов, метод позволит создавать устойчивые сорта за несколько недель, без опоры на существующие устойчивые растения.

#гмо #наука #биология #новости_науки #генетика #ИИ #селекция #генетическая_инженерия #клеточная_биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aee1792

Programmable design of synthetic plant immune receptors for pathogen protein recognition | Science
Исследователи разработали подход, позволяющий конструировать искусственные иммунные рецепторы для растений, которые могут распознавать любые заданные белки патогенов: вирусов, бактерий и грибов. В основе искусственного рецептора лежит растительный рецептор Pikm-1, в котором только заменяют «распознающий модуль» на специально спроектированный пептидный фрагмент. Этот фрагмент создают с помощью искусственного интеллекта, используя AlphaFold, BindCraft и другие инструменты, чтобы получить структуру, которая будет связывать целевой патоген. А для того, чтобы получить более эффективные рецепторы, использовали метод направленной эволюции белков внутри растительных клеток (GRAPE-based evolution). В растительную клетку вводили ген синтетического рецептора, встроенный в конструкцию на основе геминивируса. При репликации конструкции появлялись тысячи копий гена за короткое время, и при этом в них возникали случайные мутации — так получали огромную библиотеку вариантов рецептора прямо внутри клетки. И среди них, отбирали лучшие, например под действием патогена. Таким образом, по мнению авторов, метод позволит создавать устойчивые сорта за несколько недель, без опоры на существующие устойчивые растения.

#гмо #наука #биология #новости_науки #генетика #ИИ #селекция #генетическая_инженерия #клеточная_биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aee1792

Programmable design of synthetic plant immune receptors for pathogen protein recognition | Science
Исследователи разработали подход, позволяющий конструировать искусственные иммунные рецепторы для растений, которые могут распознавать любые заданные белки патогенов: вирусов, бактерий и грибов. В основе искусственного рецептора лежит растительный рецептор Pikm-1, в котором только заменяют «распознающий модуль» на специально спроектированный пептидный фрагмент. Этот фрагмент создают с помощью искусственного интеллекта, используя AlphaFold, BindCraft и другие инструменты, чтобы получить структуру, которая будет связывать целевой патоген. А для того, чтобы получить более эффективные рецепторы, использовали метод направленной эволюции белков внутри растительных клеток (GRAPE-based evolution). В растительную клетку вводили ген синтетического рецептора, встроенный в конструкцию на основе геминивируса. При репликации конструкции появлялись тысячи копий гена за короткое время, и при этом в них возникали случайные мутации — так получали огромную библиотеку вариантов рецептора прямо внутри клетки. И среди них, отбирали лучшие, например под действием патогена. Таким образом, по мнению авторов, метод позволит создавать устойчивые сорта за несколько недель, без опоры на существующие устойчивые растения.

#гмо #наука #биология #новости_науки #генетика #ИИ #селекция #генетическая_инженерия #клеточная_биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aee1792

Programmable design of synthetic plant immune receptors for pathogen protein recognition | Science
Исследователи разработали подход, позволяющий конструировать искусственные иммунные рецепторы для растений, которые могут распознавать любые заданные белки патогенов: вирусов, бактерий и грибов. В основе искусственного рецептора лежит растительный рецептор Pikm-1, в котором только заменяют «распознающий модуль» на специально спроектированный пептидный фрагмент. Этот фрагмент создают с помощью искусственного интеллекта, используя AlphaFold, BindCraft и другие инструменты, чтобы получить структуру, которая будет связывать целевой патоген. А для того, чтобы получить более эффективные рецепторы, использовали метод направленной эволюции белков внутри растительных клеток (GRAPE-based evolution). В растительную клетку вводили ген синтетического рецептора, встроенный в конструкцию на основе геминивируса. При репликации конструкции появлялись тысячи копий гена за короткое время, и при этом в них возникали случайные мутации — так получали огромную библиотеку вариантов рецептора прямо внутри клетки. И среди них, отбирали лучшие, например под действием патогена. Таким образом, по мнению авторов, метод позволит создавать устойчивые сорта за несколько недель, без опоры на существующие устойчивые растения.

#гмо #наука #биология #новости_науки #генетика #ИИ #селекция #генетическая_инженерия #клеточная_биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aee1792

Programmable design of synthetic plant immune receptors for pathogen protein recognition | Science
Исследователи разработали подход, позволяющий конструировать искусственные иммунные рецепторы для растений, которые могут распознавать любые заданные белки патогенов: вирусов, бактерий и грибов. В основе искусственного рецептора лежит растительный рецептор Pikm-1, в котором только заменяют «распознающий модуль» на специально спроектированный пептидный фрагмент. Этот фрагмент создают с помощью искусственного интеллекта, используя AlphaFold, BindCraft и другие инструменты, чтобы получить структуру, которая будет связывать целевой патоген. А для того, чтобы получить более эффективные рецепторы, использовали метод направленной эволюции белков внутри растительных клеток (GRAPE-based evolution). В растительную клетку вводили ген синтетического рецептора, встроенный в конструкцию на основе геминивируса. При репликации конструкции появлялись тысячи копий гена за короткое время, и при этом в них возникали случайные мутации — так получали огромную библиотеку вариантов рецептора прямо внутри клетки. И среди них, отбирали лучшие, например под действием патогена. Таким образом, по мнению авторов, метод позволит создавать устойчивые сорта за несколько недель, без опоры на существующие устойчивые растения.

#гмо #наука #биология #новости_науки #генетика #ИИ #селекция #генетическая_инженерия #клеточная_биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aee1792

Tumor-derived antioxidants suppress immunity by depriving T cells of reactive oxygen species | Science
Всякое орудие само по себе - ни добро и не зло. Сие определяется лишь по тому, как мы используем оное.
Мы привыкли считать, что активные формы кислорода (АФК) опасны и вредны для клеток: они напрямую повреждают ДНК, вызывая мутации, и повреждают белки, поддерживая сигнальные пути, которые могут способствовать развитию онкологии. Но даже у такого «абсолютного зла» нашлась светлая сторона: оказалось, что АФК участвуют в активации Т-клеток, тем самым помогая иммунной системе атаковать опухоли. Эта парадоксальная роль АФК описана в новом выпуске Science. Дело в том, что в Т-клетках АФК окисляют определенные фосфатазы, выключая их, а подавление активности фосфатаз необходимо для активации Т-клеток.
Поразительно, что опухоли имеют механизм, который мешает такому пути активации Т-клеток. Они выделяют в межклеточную среду антиоксидант — пероксиредоксин 1, который не дает АФК поддержать активацию Т-клеток после контакта с опухолевыми клетками.

#клеточная_биология #наука #новости_науки #иммунология #биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adz8203

Tumor-derived antioxidants suppress immunity by depriving T cells of reactive oxygen species | Science
Всякое орудие само по себе - ни добро и не зло. Сие определяется лишь по тому, как мы используем оное.
Мы привыкли считать, что активные формы кислорода (АФК) опасны и вредны для клеток: они напрямую повреждают ДНК, вызывая мутации, и повреждают белки, поддерживая сигнальные пути, которые могут способствовать развитию онкологии. Но даже у такого «абсолютного зла» нашлась светлая сторона: оказалось, что АФК участвуют в активации Т-клеток, тем самым помогая иммунной системе атаковать опухоли. Эта парадоксальная роль АФК описана в новом выпуске Science. Дело в том, что в Т-клетках АФК окисляют определенные фосфатазы, выключая их, а подавление активности фосфатаз необходимо для активации Т-клеток.
Поразительно, что опухоли имеют механизм, который мешает такому пути активации Т-клеток. Они выделяют в межклеточную среду антиоксидант — пероксиредоксин 1, который не дает АФК поддержать активацию Т-клеток после контакта с опухолевыми клетками.

#клеточная_биология #наука #новости_науки #иммунология #биология
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adz8203

Научные джунгли России: не ходите, дети, в учёные

Когда-то, ещё в школьные годы, я всерьёз задумывался о том, чтобы посвятить свою жизнь науке. В старших классах мои взгляды изменились, и уже в 10–11 классе я отказался от этой идеи по ряду причин. Учёба в университете только подтвердила правильность этого решения. Но тогда мне даже в голову не приходило, насколько хуже станет ситуация всего через десять лет. Эта статья — предупреждение. Она о том, с чем придётся столкнуться тем, кто только размышляет о том, чтобы связать свою судьбу с наукой.

https://habr.com/ru/articles/866368/

#наука_в_россии #Проблемы_науки #Научная_сфера_в_России #образование #наука #Работа_учёным_в_России #Проблемы_науки_в_России #Кризис_науки_в_России #тотальный_контроль #кризис