#днк — Public Fediverse posts

[Перевод] Прочитал свой геном на кухне и превратил мазок щеки в 30 гигабаз данных ДНК

Автор прочитал свой геном прямо на кухонном столе. В статье — полный протокол без воды: какое железо купить, как не слить бюджет на проточную ячейку и как настроить таргетное обогащение, чтобы получить ответы именно по вашим вопросам. Переходите, если хотите понять, как устроена современная DIY-генетика и с чего начать свой первый прогон. Перейти к гайду

https://habr.com/ru/companies/flant/articles/1031594/

#секвенирование #геном #проточная_ячейка #minion #MinKNOW #лигирование #днк #спинколонка #Aтейлинг

Кроим ДНК на Python — CRISPR gRNA finder, Часть II: Скоринг, off-target и реальный ген

В первой части мы написали базовый поиск gRNA с фильтрацией по GC-составу. Работает, но тупо: все кандидаты в диапазоне 40-60% считаются равнозначными. В реальности это не так. Сегодня добавим систему скоринга — будем ранжировать gRNA по качеству, учитывая позицию нуклеотидов и особенности U6-промотора. Потом подключим NCBI BLAST, чтобы проверять кандидатов на off-target: не порежет ли Cas9 что-нибудь лишнее в геноме. Тестировать будем на гене CCR5 — том самом, который отредактировал китайский учёный Хэ Цзянькуй в скандальном эксперименте 2018 года.

https://habr.com/ru/articles/982876/

#днк #cas9 #crispr #генетика #генная_инженерия #биоинформатика #биоинженерия #анализ_днк

Кроим ДНК на Python: CRISPR gRNA finder, Часть I: Введение и базовый поиск

Несколько лет назад я наткнулся на статью про CRISPR‑Cas9 и домашние биолаборатории — люди буквально у себя дома экспериментировали с редактированием генов. Я бэкенд‑разработчик, биологию последний раз открывал в школе, но желание разобраться никуда не делось. В этой статье разберёмся, как работает CRISPR на минимальном уровне, и напишем CLI‑утилиту на Python для поиска потенциальных guide RNA — «наводчиков» для молекулярных ножниц Cas9.

https://habr.com/ru/articles/982664/

#биоинформатика #биоинженерия #cas9 #crispr #днк #анализ_днк #чайникчайнику

Есть ли надежда на бессмертие и как в этом помогает AI?

О текущих исследованиях замедления старения, регенерации клеток, биологического возраста и приближении с разгадке тайны старения через искусственный интеллект.

https://habr.com/ru/articles/967112/

#Старение #борьба_со_старением #Бессмертие #ИИ #яманака #биоинжерения #ДНК #Александр_Сто #iposharks #Джоан_Манник

Есть ли надежда на бессмертие и как в этом помогает AI?

О текущих исследованиях замедления старения, регенерации клеток, биологического возраста и приближении с разгадке тайны старения через искусственный интеллект.

https://habr.com/ru/articles/967112/

#Старение #борьба_со_старением #Бессмертие #ИИ #яманака #биоинжерения #ДНК #Александр_Сто #iposharks #Джоан_Манник

Есть ли надежда на бессмертие и как в этом помогает AI?

О текущих исследованиях замедления старения, регенерации клеток, биологического возраста и приближении с разгадке тайны старения через искусственный интеллект.

https://habr.com/ru/articles/967112/

#Старение #борьба_со_старением #Бессмертие #ИИ #яманака #биоинжерения #ДНК #Александр_Сто #iposharks #Джоан_Манник

Есть ли надежда на бессмертие и как в этом помогает AI?

О текущих исследованиях замедления старения, регенерации клеток, биологического возраста и приближении с разгадке тайны старения через искусственный интеллект.

https://habr.com/ru/articles/967112/

#Старение #борьба_со_старением #Бессмертие #ИИ #яманака #биоинжерения #ДНК #Александр_Сто #iposharks #Джоан_Манник

Биоробот с ДНК лягушки: ксеноботы и эволюционные алгоритмы

Мы решили написать небольшой "развлекательный материал" на тему биороботов в контексте искусственного интеллекта и отвлечься от технической части наших статей Подход искусственного интеллекта не предполагает имитацию человеческого мозга или любого другого животного. Лишь некоторые "специфические" проекты стремятся к репликации нейронных процессов/когнитивных способностей. Хотя и классические MLP вдохновлены активациями и построением нейронных связей внутри нашего мозга. Все же, это не их самоцель. Биоробот — синтез робототехники и органических тканей. И этот синтез — сложен. Достаточно трудно добиться адекватной формы тела животного для воссоздания важных функций типичных живых представителей нашего мира. Сегодня поговорим про существо, начисто состоящее исключительно из ДНК лягушки, внешний вид которого придумали нейросети.

https://habr.com/ru/articles/828338/

#биороботы #днк #эволюционные_алгоритмы #научнопопулярное #искусственный_интеллект #машинное_обучение #sklearn

Гений Бетховена: генетическая предрасположенность или случайность

Одним из аспектов, изучаемых генетикой, является наследственность. Физиологические особенности, такие как цвет глаз, цвет волос, рост, комплекция, предрасположенность к определенным заболеваниям, могут передаваться из поколения в поколение. Учитывая это, ученые также пытались понять, существуют ли какие-то генетические факторы, влияющие на навыки человека. Если родители обладают удивительными, к примеру, математическими навыками, передастся ли это их ребенку? Многие ученые уверены, что да, однако полноценных материальных подтверждений этому мало. Порой результаты исследований и вовсе говорят об обратном. Ученые из Медицинского центра Вандербильтского университета (США) изучили ДНК великого композитора Людвига ван Бетховена, извлеченное из его волос, и попытались оценить его генетическую предрасположенность к музыке. Как ученые искали музыкальный дар Бетховена, что им удалось найти, и есть ли связь между генетикой и навыками? Ответы на эти вопросы мы найдем в докладе ученых.

https://habr.com/ru/companies/ua-hosting/articles/803511/

#Бетховен #музыка #навыки #талант #генетика #ДНК #секвенирование_генома #PGI #GWAS #человек #мозг #способности