#днк — Public Fediverse posts
Live and recent posts from across the Fediverse tagged #днк, aggregated by home.social.
-
Хромосомы и их проблемы
Помните длинные закрученные цепочки молекул ДНК с красивых картинок? Так вот, в реальности они выглядят несколько иначе. Во-первых, клетке нужно очень много днк. Если растянуть всю днк содержащуюся в одном ядре, то получится около двух метров. Чтобы всё это поместилось в ядро, размеры которого составляют 6 мкм (6 миллионных метра), днк многократно скручивается или, как говорят учёные, спирализуется. Так как толщина нити днк очень маленькая, то в скрученном в некоторое подобие клубка состоянии она занимает не так уж и много места. Но скручивается она не полностью. Те части молекулы днк, которые нужны клетке в данный момент не спирализуются или спирализуются в меньшей степени. На знаменитое изображение двойной спирали (на самом деле грамотнее говорить двойного винта) похожи только те части, которые недавно работали или собираются приступить к работе.
-
Хромосомы и их проблемы
Помните длинные закрученные цепочки молекул ДНК с красивых картинок? Так вот, в реальности они выглядят несколько иначе. Во-первых, клетке нужно очень много днк. Если растянуть всю днк содержащуюся в одном ядре, то получится около двух метров. Чтобы всё это поместилось в ядро, размеры которого составляют 6 мкм (6 миллионных метра), днк многократно скручивается или, как говорят учёные, спирализуется. Так как толщина нити днк очень маленькая, то в скрученном в некоторое подобие клубка состоянии она занимает не так уж и много места. Но скручивается она не полностью. Те части молекулы днк, которые нужны клетке в данный момент не спирализуются или спирализуются в меньшей степени. На знаменитое изображение двойной спирали (на самом деле грамотнее говорить двойного винта) похожи только те части, которые недавно работали или собираются приступить к работе.
-
Хромосомы и их проблемы
Помните длинные закрученные цепочки молекул ДНК с красивых картинок? Так вот, в реальности они выглядят несколько иначе. Во-первых, клетке нужно очень много днк. Если растянуть всю днк содержащуюся в одном ядре, то получится около двух метров. Чтобы всё это поместилось в ядро, размеры которого составляют 6 мкм (6 миллионных метра), днк многократно скручивается или, как говорят учёные, спирализуется. Так как толщина нити днк очень маленькая, то в скрученном в некоторое подобие клубка состоянии она занимает не так уж и много места. Но скручивается она не полностью. Те части молекулы днк, которые нужны клетке в данный момент не спирализуются или спирализуются в меньшей степени. На знаменитое изображение двойной спирали (на самом деле грамотнее говорить двойного винта) похожи только те части, которые недавно работали или собираются приступить к работе.
-
Хромосомы и их проблемы
Помните длинные закрученные цепочки молекул ДНК с красивых картинок? Так вот, в реальности они выглядят несколько иначе. Во-первых, клетке нужно очень много днк. Если растянуть всю днк содержащуюся в одном ядре, то получится около двух метров. Чтобы всё это поместилось в ядро, размеры которого составляют 6 мкм (6 миллионных метра), днк многократно скручивается или, как говорят учёные, спирализуется. Так как толщина нити днк очень маленькая, то в скрученном в некоторое подобие клубка состоянии она занимает не так уж и много места. Но скручивается она не полностью. Те части молекулы днк, которые нужны клетке в данный момент не спирализуются или спирализуются в меньшей степени. На знаменитое изображение двойной спирали (на самом деле грамотнее говорить двойного винта) похожи только те части, которые недавно работали или собираются приступить к работе.
-
Как «мусорная ДНК» обеспечила эволюцию мозга
Буквально лет 20 назад мир охватил нарратив, дескать мы используем только 10% своего мозга. И фильмы «Люси», «Области Тьмы» и даже «Ученик Чародея» активно использовали этот баг интерпретации. Но, точно также, существует мнение, что огромная часть нашей ДНК – это мусор, накопившийся как атавизм за годы эволюции. Что ж, новое исследование показывает, что часть этой «мусорной ДНК» буквально затащила наш мозг на вершину эволюции. И нас вместе с ним. Вооружиться неогеновым лазером
https://habr.com/ru/articles/1034530/
#эволюция #эволюция_мозга #эволюция_разума #эволюция_сознания #ДНК #гены #мусорные_гены #генетический_мусор #генетика #геном
-
Как «мусорная ДНК» обеспечила эволюцию мозга
Буквально лет 20 назад мир охватил нарратив, дескать мы используем только 10% своего мозга. И фильмы «Люси», «Области Тьмы» и даже «Ученик Чародея» активно использовали этот баг интерпретации. Но, точно также, существует мнение, что огромная часть нашей ДНК – это мусор, накопившийся как атавизм за годы эволюции. Что ж, новое исследование показывает, что часть этой «мусорной ДНК» буквально затащила наш мозг на вершину эволюции. И нас вместе с ним. Вооружиться неогеновым лазером
https://habr.com/ru/articles/1034530/
#эволюция #эволюция_мозга #эволюция_разума #эволюция_сознания #ДНК #гены #мусорные_гены #генетический_мусор #генетика #геном
-
Как «мусорная ДНК» обеспечила эволюцию мозга
Буквально лет 20 назад мир охватил нарратив, дескать мы используем только 10% своего мозга. И фильмы «Люси», «Области Тьмы» и даже «Ученик Чародея» активно использовали этот баг интерпретации. Но, точно также, существует мнение, что огромная часть нашей ДНК – это мусор, накопившийся как атавизм за годы эволюции. Что ж, новое исследование показывает, что часть этой «мусорной ДНК» буквально затащила наш мозг на вершину эволюции. И нас вместе с ним. Вооружиться неогеновым лазером
https://habr.com/ru/articles/1034530/
#эволюция #эволюция_мозга #эволюция_разума #эволюция_сознания #ДНК #гены #мусорные_гены #генетический_мусор #генетика #геном
-
Как «мусорная ДНК» обеспечила эволюцию мозга
Буквально лет 20 назад мир охватил нарратив, дескать мы используем только 10% своего мозга. И фильмы «Люси», «Области Тьмы» и даже «Ученик Чародея» активно использовали этот баг интерпретации. Но, точно также, существует мнение, что огромная часть нашей ДНК – это мусор, накопившийся как атавизм за годы эволюции. Что ж, новое исследование показывает, что часть этой «мусорной ДНК» буквально затащила наш мозг на вершину эволюции. И нас вместе с ним. Вооружиться неогеновым лазером
https://habr.com/ru/articles/1034530/
#эволюция #эволюция_мозга #эволюция_разума #эволюция_сознания #ДНК #гены #мусорные_гены #генетический_мусор #генетика #геном
-
[Перевод] Прочитал свой геном на кухне и превратил мазок щеки в 30 гигабаз данных ДНК
Автор прочитал свой геном прямо на кухонном столе. В статье — полный протокол без воды: какое железо купить, как не слить бюджет на проточную ячейку и как настроить таргетное обогащение, чтобы получить ответы именно по вашим вопросам. Переходите, если хотите понять, как устроена современная DIY-генетика и с чего начать свой первый прогон. Перейти к гайду
https://habr.com/ru/companies/flant/articles/1031594/
#секвенирование #геном #проточная_ячейка #minion #MinKNOW #лигирование #днк #спинколонка #Aтейлинг
-
[Перевод] Прочитал свой геном на кухне и превратил мазок щеки в 30 гигабаз данных ДНК
Автор прочитал свой геном прямо на кухонном столе. В статье — полный протокол без воды: какое железо купить, как не слить бюджет на проточную ячейку и как настроить таргетное обогащение, чтобы получить ответы именно по вашим вопросам. Переходите, если хотите понять, как устроена современная DIY-генетика и с чего начать свой первый прогон. Перейти к гайду
https://habr.com/ru/companies/flant/articles/1031594/
#секвенирование #геном #проточная_ячейка #minion #MinKNOW #лигирование #днк #спинколонка #Aтейлинг
-
[Перевод] Прочитал свой геном на кухне и превратил мазок щеки в 30 гигабаз данных ДНК
Автор прочитал свой геном прямо на кухонном столе. В статье — полный протокол без воды: какое железо купить, как не слить бюджет на проточную ячейку и как настроить таргетное обогащение, чтобы получить ответы именно по вашим вопросам. Переходите, если хотите понять, как устроена современная DIY-генетика и с чего начать свой первый прогон. Перейти к гайду
https://habr.com/ru/companies/flant/articles/1031594/
#секвенирование #геном #проточная_ячейка #minion #MinKNOW #лигирование #днк #спинколонка #Aтейлинг
-
[Перевод] Прочитал свой геном на кухне и превратил мазок щеки в 30 гигабаз данных ДНК
Автор прочитал свой геном прямо на кухонном столе. В статье — полный протокол без воды: какое железо купить, как не слить бюджет на проточную ячейку и как настроить таргетное обогащение, чтобы получить ответы именно по вашим вопросам. Переходите, если хотите понять, как устроена современная DIY-генетика и с чего начать свой первый прогон. Перейти к гайду
https://habr.com/ru/companies/flant/articles/1031594/
#секвенирование #геном #проточная_ячейка #minion #MinKNOW #лигирование #днк #спинколонка #Aтейлинг
-
Биологический квайн: программа из 75 букв ДНК, которая копирует сама себя
Если задать гуглу вопрос «какая система счисления у ДНК», он честно скажет — четверичная. Четыре буквы (A, C, G, T) кодируют всё, что есть в живом. Каждые три подряд — кодон, итого 64 комбинации, чего хватает с запасом на любой опкод компактной стек-машины. Я подумал: это же буквально готовый язык программирования. Природа уже нарисовала байткод, осталось написать виртуальную рибосому и проверить — можно ли в этом байткоде сделать квайн — программу, которая печатает сама себя. Самовоспроизводящуюся последовательность. Спойлер: можно. И влезает в 75 нуклеотидов. Это меньше, чем длина среднего твита. В этой статье я расскажу, как устроена эта штука: соберём четверичный байткод из ДНК, напишем стек-машину, которая по нему ходит, а в конце — соберём 75-нуклеотидный геном, который копирует сам себя нуклеотид за нуклеотидом. Дальше из этого вырастет 3D-симуляция тканей, эволюция и драматичная история про вымирание колонии — но это будут следующие статьи серии.
https://habr.com/ru/articles/1028184/
#днк #квайн #биология #генетический_код #эволюционные_алгоритмы #биоинформатика #искусственная_жизнь #научнопопулярное
-
Краткая история биометрии: как ПЦР-метод изменил идентификацию по ДНК
В 1980-е годы произошли еще два события, благодаря которым биометрия теоретически превращалась в абсолютно точную науку. В 1984 генетик из Лестерского университета Алек Джеффрис открыл в ДНК человека повторяющиеся последовательности нуклеотидов, уникальные для каждого человека, а в следующем 1985 году в журнале «Nature» он опубликовал одну за другой две статьи, которые сделали его открытие, как любили говорить как раз в те годы в нашей стране, достоянием гласности. В номере «Nature» от 7 марта 1985 года в статье под заголовком «Гипервариабельные «минисателлитные» участки в ДНК человека» он писал: «Геном человека содержит множество диспергированных тандемно повторяющихся «минисателлитных» участков из 10-15 пар оснований… Многие минисателлиты сильно полиморфны из-за аллельных вариаций в количестве копий повторов в минисателлитах. Зонд, основанный на тандемном повторении ядерной последовательности, может одновременно обнаруживать множество сильно вариабельных локусов и служить индивидуальным “отпечатком” ДНК при генетическом анализе человека».
https://habr.com/ru/companies/onlinepatent/articles/1027392/
#пцртест #пцр #днктест #днк #биометрия #биометрическая_идентификация #биометрическая_аутентификация #биометрические_системы #патентование #история_науки
-
Краткая история биометрии: как ПЦР-метод изменил идентификацию по ДНК
В 1980-е годы произошли еще два события, благодаря которым биометрия теоретически превращалась в абсолютно точную науку. В 1984 генетик из Лестерского университета Алек Джеффрис открыл в ДНК человека повторяющиеся последовательности нуклеотидов, уникальные для каждого человека, а в следующем 1985 году в журнале «Nature» он опубликовал одну за другой две статьи, которые сделали его открытие, как любили говорить как раз в те годы в нашей стране, достоянием гласности. В номере «Nature» от 7 марта 1985 года в статье под заголовком «Гипервариабельные «минисателлитные» участки в ДНК человека» он писал: «Геном человека содержит множество диспергированных тандемно повторяющихся «минисателлитных» участков из 10-15 пар оснований… Многие минисателлиты сильно полиморфны из-за аллельных вариаций в количестве копий повторов в минисателлитах. Зонд, основанный на тандемном повторении ядерной последовательности, может одновременно обнаруживать множество сильно вариабельных локусов и служить индивидуальным “отпечатком” ДНК при генетическом анализе человека».
https://habr.com/ru/companies/onlinepatent/articles/1027392/
#пцртест #пцр #днктест #днк #биометрия #биометрическая_идентификация #биометрическая_аутентификация #биометрические_системы #патентование #история_науки
-
Краткая история биометрии: как ПЦР-метод изменил идентификацию по ДНК
В 1980-е годы произошли еще два события, благодаря которым биометрия теоретически превращалась в абсолютно точную науку. В 1984 генетик из Лестерского университета Алек Джеффрис открыл в ДНК человека повторяющиеся последовательности нуклеотидов, уникальные для каждого человека, а в следующем 1985 году в журнале «Nature» он опубликовал одну за другой две статьи, которые сделали его открытие, как любили говорить как раз в те годы в нашей стране, достоянием гласности. В номере «Nature» от 7 марта 1985 года в статье под заголовком «Гипервариабельные «минисателлитные» участки в ДНК человека» он писал: «Геном человека содержит множество диспергированных тандемно повторяющихся «минисателлитных» участков из 10-15 пар оснований… Многие минисателлиты сильно полиморфны из-за аллельных вариаций в количестве копий повторов в минисателлитах. Зонд, основанный на тандемном повторении ядерной последовательности, может одновременно обнаруживать множество сильно вариабельных локусов и служить индивидуальным “отпечатком” ДНК при генетическом анализе человека».
https://habr.com/ru/companies/onlinepatent/articles/1027392/
#пцртест #пцр #днктест #днк #биометрия #биометрическая_идентификация #биометрическая_аутентификация #биометрические_системы #патентование #история_науки
-
Краткая история биометрии: как ПЦР-метод изменил идентификацию по ДНК
В 1980-е годы произошли еще два события, благодаря которым биометрия теоретически превращалась в абсолютно точную науку. В 1984 генетик из Лестерского университета Алек Джеффрис открыл в ДНК человека повторяющиеся последовательности нуклеотидов, уникальные для каждого человека, а в следующем 1985 году в журнале «Nature» он опубликовал одну за другой две статьи, которые сделали его открытие, как любили говорить как раз в те годы в нашей стране, достоянием гласности. В номере «Nature» от 7 марта 1985 года в статье под заголовком «Гипервариабельные «минисателлитные» участки в ДНК человека» он писал: «Геном человека содержит множество диспергированных тандемно повторяющихся «минисателлитных» участков из 10-15 пар оснований… Многие минисателлиты сильно полиморфны из-за аллельных вариаций в количестве копий повторов в минисателлитах. Зонд, основанный на тандемном повторении ядерной последовательности, может одновременно обнаруживать множество сильно вариабельных локусов и служить индивидуальным “отпечатком” ДНК при генетическом анализе человека».
https://habr.com/ru/companies/onlinepatent/articles/1027392/
#пцртест #пцр #днктест #днк #биометрия #биометрическая_идентификация #биометрическая_аутентификация #биометрические_системы #патентование #история_науки
-
NETоз: собственная ДНК как… оружие?
Как известно, ДНК служит хранилищем всей информации, необходимой клетке для развития, поддержания своего существования и выполнения своей функции. Около двух метров хроматина (ДНК в комплексе с белками – гистонами) лежит в ядре каждой клетки в конденсированном (чудовищно свернутом) виде – немудрено и запутаться. Было бы очень скучно, если бы это сокровище не нашло бы применения получше, чем просто какое-то там хранилище информации. И такое применение нашлось!
-
NETоз: собственная ДНК как… оружие?
Как известно, ДНК служит хранилищем всей информации, необходимой клетке для развития, поддержания своего существования и выполнения своей функции. Около двух метров хроматина (ДНК в комплексе с белками – гистонами) лежит в ядре каждой клетки в конденсированном (чудовищно свернутом) виде – немудрено и запутаться. Было бы очень скучно, если бы это сокровище не нашло бы применения получше, чем просто какое-то там хранилище информации. И такое применение нашлось!
-
NETоз: собственная ДНК как… оружие?
Как известно, ДНК служит хранилищем всей информации, необходимой клетке для развития, поддержания своего существования и выполнения своей функции. Около двух метров хроматина (ДНК в комплексе с белками – гистонами) лежит в ядре каждой клетки в конденсированном (чудовищно свернутом) виде – немудрено и запутаться. Было бы очень скучно, если бы это сокровище не нашло бы применения получше, чем просто какое-то там хранилище информации. И такое применение нашлось!
-
NETоз: собственная ДНК как… оружие?
Как известно, ДНК служит хранилищем всей информации, необходимой клетке для развития, поддержания своего существования и выполнения своей функции. Около двух метров хроматина (ДНК в комплексе с белками – гистонами) лежит в ядре каждой клетки в конденсированном (чудовищно свернутом) виде – немудрено и запутаться. Было бы очень скучно, если бы это сокровище не нашло бы применения получше, чем просто какое-то там хранилище информации. И такое применение нашлось!
-
[Перевод] Эволюция человека резко ускорилась после начала земледелия
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание. Там, где раньше мы видели лишь статистический шум, теперь очевиден жесткий направленный отбор.
https://habr.com/ru/articles/1024476/
#эволюция #антропогенез #биология #генетика #биоинформатика #история_человека #днк #естественный_отбор #адаптация #неолит
-
[Перевод] Эволюция человека резко ускорилась после начала земледелия
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание. Там, где раньше мы видели лишь статистический шум, теперь очевиден жесткий направленный отбор.
https://habr.com/ru/articles/1024476/
#эволюция #антропогенез #биология #генетика #биоинформатика #история_человека #днк #естественный_отбор #адаптация #неолит
-
[Перевод] Эволюция человека резко ускорилась после начала земледелия
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание. Там, где раньше мы видели лишь статистический шум, теперь очевиден жесткий направленный отбор.
https://habr.com/ru/articles/1024476/
#эволюция #антропогенез #биология #генетика #биоинформатика #история_человека #днк #естественный_отбор #адаптация #неолит
-
[Перевод] Эволюция человека резко ускорилась после начала земледелия
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание. Там, где раньше мы видели лишь статистический шум, теперь очевиден жесткий направленный отбор.
https://habr.com/ru/articles/1024476/
#эволюция #антропогенез #биология #генетика #биоинформатика #история_человека #днк #естественный_отбор #адаптация #неолит
-
ДНК как носитель данных: биология приходит в электронную отрасль
По мере развития вычислений и систем искусственного интеллекта привычные устройства хранения данных все хуже справляются с нагрузкой. Они требуют больше энергии, а повышать плотность записи становится сложнее. На этом фоне появляются необычные решения. Например, ученые из Пенсильванского университета соединили синтетические фрагменты ДНК с полупроводниковым материалом и получили гибридный мемристор. Его выделяет стабильность работы и очень низкое энергопотребление.
-
Защитимся от вирусов радикально и навсегда
Защитимся от вирусов! Представьте мир, в котором Covid, ВИЧ, гепатит и герпес — это не болезни, а исторические факты. Мир, где сезонный грипп не валит с ног, а новые пандемии просто не могут начаться, потому что вирусы не могут размножиться. Давайте посмотрим на проблему с высоты птичьего полёта и предложим решение, которое заставит эволюцию вирусов отстать от человечества на миллион лет.
https://habr.com/ru/companies/ruvds/articles/1008790/
#защита_от_вирусов #иммунитет #ДНК #кодоны #генная_инженерия #ruvds_статьи
-
Защитимся от вирусов радикально и навсегда
Защитимся от вирусов! Представьте мир, в котором Covid, ВИЧ, гепатит и герпес — это не болезни, а исторические факты. Мир, где сезонный грипп не валит с ног, а новые пандемии просто не могут начаться, потому что вирусы не могут размножиться. Давайте посмотрим на проблему с высоты птичьего полёта и предложим решение, которое заставит эволюцию вирусов отстать от человечества на миллион лет.
https://habr.com/ru/companies/ruvds/articles/1008790/
#защита_от_вирусов #иммунитет #ДНК #кодоны #генная_инженерия #ruvds_статьи
-
Защитимся от вирусов радикально и навсегда
Защитимся от вирусов! Представьте мир, в котором Covid, ВИЧ, гепатит и герпес — это не болезни, а исторические факты. Мир, где сезонный грипп не валит с ног, а новые пандемии просто не могут начаться, потому что вирусы не могут размножиться. Давайте посмотрим на проблему с высоты птичьего полёта и предложим решение, которое заставит эволюцию вирусов отстать от человечества на миллион лет.
https://habr.com/ru/companies/ruvds/articles/1008790/
#защита_от_вирусов #иммунитет #ДНК #кодоны #генная_инженерия #ruvds_статьи
-
Защитимся от вирусов радикально и навсегда
Защитимся от вирусов! Представьте мир, в котором Covid, ВИЧ, гепатит и герпес — это не болезни, а исторические факты. Мир, где сезонный грипп не валит с ног, а новые пандемии просто не могут начаться, потому что вирусы не могут размножиться. Давайте посмотрим на проблему с высоты птичьего полёта и предложим решение, которое заставит эволюцию вирусов отстать от человечества на миллион лет.
https://habr.com/ru/companies/ruvds/articles/1008790/
#защита_от_вирусов #иммунитет #ДНК #кодоны #генная_инженерия #ruvds_статьи
-
Люди, які цікавляться своїм родоводом, обов'язково тестують свою ДНК. Але #Франція такі тести заборонила, крім випадків, коли тести призначені доктором або судом.
Заборона генеалогічних #ДНК тестів (від місцевих компаній) не заважає французам тестувати свою ДНК у зарубіжних компаніях. Всі, кому цікаво, вже тести зробили, і нікого за це ще не оштрафували.
#DNA #myheritage #FTDNA #France #french -
Люди, які цікавляться своїм родоводом, обов'язково тестують свою ДНК. Але #Франція такі тести заборонила, крім випадків, коли тести призначені доктором або судом.
Заборона генеалогічних #ДНК тестів (від місцевих компаній) не заважає французам тестувати свою ДНК у зарубіжних компаніях. Всі, кому цікаво, вже тести зробили, і нікого за це ще не оштрафували.
#DNA #myheritage #FTDNA #France #french -
[Перевод] О регулировании технологий, позволяющих родителям «оценивать» эмбрионы, полученные в результате ЭКО
«Если я дам людям диагностический инструмент, который позволит им получить ребёнка, у которого в три раза выше шансы поступить в MIT, я думаю, что люди будут заинтересованы». Хотя это звучит как фраза из научно-фантастического фильма, на самом деле это цитата Стива Хсу , профессора физики Мичиганского государственного университета и соучредителя Genomic Prediction — компании, которая предлагает родителям новую технологию под названием полигенный отбор эмбрионов. В фильме 1997 года « Гаттака » мышление, отражённое в высказывании Хсу, привело к антиутопии, где дети зачинались в лабораториях, а общество делилось на генетически обеспеченных и необеспеченных. Когда фильм только вышел, репродуктивные технологии, изображённые в нём, были научной фантастикой, но сегодня они быстро становятся научной реальностью.
-
Темный протеом, или Как микробелки прятались в геноме на виду у всех
Расшифровав человеческий геном (им, кстати, был геном самого Джеймса Уотсона, одного из авторов модели двойной спирали ДНК), ученые недолго довольствовались результатом. Наука концентрировалась на больших генах, кодирующих крупные белки длиной в ~300 аминокислот, но обнаружилось, что такие гены занимают всего ~1–2% ДНК. Все остальное, по логике экономии объяснений, решено было считать «мусором» — junk DNA , накопившимся побочным продуктом эволюции. Еще до открытия структуры ДНК Уотсон и Крик наблюдали случаи, когда темный протеом (или «темная материя генома», по выражению журналиста New Scientist) вел себя далеко не пассивно. А через полвека обнаружилось: то, что считали шумом и мусором, скрывает миллионы smORF (малых открытых рамок считывания), способных кодировать небольшие белковые соединения — микропротеины . По разным оценкам, в человеческом геноме может существовать ~3 млн таких потенциальных микробелков. Экспериментально подтверждено — лишь ~1 200 . Функции известны и того меньше. Было очень мало способов понять, какие из них действительно важны. Пока не пришел ИИ
-
Темный протеом, или Как микробелки прятались в геноме на виду у всех
Расшифровав человеческий геном (им, кстати, был геном самого Джеймса Уотсона, одного из авторов модели двойной спирали ДНК), ученые недолго довольствовались результатом. Наука концентрировалась на больших генах, кодирующих крупные белки длиной в ~300 аминокислот, но обнаружилось, что такие гены занимают всего ~1–2% ДНК. Все остальное, по логике экономии объяснений, решено было считать «мусором» — junk DNA , накопившимся побочным продуктом эволюции. Еще до открытия структуры ДНК Уотсон и Крик наблюдали случаи, когда темный протеом (или «темная материя генома», по выражению журналиста New Scientist) вел себя далеко не пассивно. А через полвека обнаружилось: то, что считали шумом и мусором, скрывает миллионы smORF (малых открытых рамок считывания), способных кодировать небольшие белковые соединения — микропротеины . По разным оценкам, в человеческом геноме может существовать ~3 млн таких потенциальных микробелков. Экспериментально подтверждено — лишь ~1 200 . Функции известны и того меньше. Было очень мало способов понять, какие из них действительно важны. Пока не пришел ИИ
-
Темный протеом, или Как микробелки прятались в геноме на виду у всех
Расшифровав человеческий геном (им, кстати, был геном самого Джеймса Уотсона, одного из авторов модели двойной спирали ДНК), ученые недолго довольствовались результатом. Наука концентрировалась на больших генах, кодирующих крупные белки длиной в ~300 аминокислот, но обнаружилось, что такие гены занимают всего ~1–2% ДНК. Все остальное, по логике экономии объяснений, решено было считать «мусором» — junk DNA , накопившимся побочным продуктом эволюции. Еще до открытия структуры ДНК Уотсон и Крик наблюдали случаи, когда темный протеом (или «темная материя генома», по выражению журналиста New Scientist) вел себя далеко не пассивно. А через полвека обнаружилось: то, что считали шумом и мусором, скрывает миллионы smORF (малых открытых рамок считывания), способных кодировать небольшие белковые соединения — микропротеины . По разным оценкам, в человеческом геноме может существовать ~3 млн таких потенциальных микробелков. Экспериментально подтверждено — лишь ~1 200 . Функции известны и того меньше. Было очень мало способов понять, какие из них действительно важны. Пока не пришел ИИ
-
Темный протеом, или Как микробелки прятались в геноме на виду у всех
Расшифровав человеческий геном (им, кстати, был геном самого Джеймса Уотсона, одного из авторов модели двойной спирали ДНК), ученые недолго довольствовались результатом. Наука концентрировалась на больших генах, кодирующих крупные белки длиной в ~300 аминокислот, но обнаружилось, что такие гены занимают всего ~1–2% ДНК. Все остальное, по логике экономии объяснений, решено было считать «мусором» — junk DNA , накопившимся побочным продуктом эволюции. Еще до открытия структуры ДНК Уотсон и Крик наблюдали случаи, когда темный протеом (или «темная материя генома», по выражению журналиста New Scientist) вел себя далеко не пассивно. А через полвека обнаружилось: то, что считали шумом и мусором, скрывает миллионы smORF (малых открытых рамок считывания), способных кодировать небольшие белковые соединения — микропротеины . По разным оценкам, в человеческом геноме может существовать ~3 млн таких потенциальных микробелков. Экспериментально подтверждено — лишь ~1 200 . Функции известны и того меньше. Было очень мало способов понять, какие из них действительно важны. Пока не пришел ИИ
-
Улучшаем геном человека: пересобираем хромосомы и избавляемся от «мёртвого» кода
Представьте, что вы получили в наследство проект, который писали 4 миллиарда лет. Документации нет, автор (Эволюция) — типичный адепт «быстрого прототипирования», который фигачил костыль на костыль, лишь бы оно не развалилось в продакшене прямо сейчас. В итоге мы имеем систему, где в каждой клетке подгружен весь исходный код огромного организма, 90% которого просто закрыто «заглушками». Сегодня мы поговорим о том, почему наш геном — это архитектурный кошмар, и как мы будем его рефакторить в ближайшем будущем.
-
Кроим ДНК на Python — CRISPR gRNA finder, Часть II: Скоринг, off-target и реальный ген
В первой части мы написали базовый поиск gRNA с фильтрацией по GC-составу. Работает, но тупо: все кандидаты в диапазоне 40-60% считаются равнозначными. В реальности это не так. Сегодня добавим систему скоринга — будем ранжировать gRNA по качеству, учитывая позицию нуклеотидов и особенности U6-промотора. Потом подключим NCBI BLAST, чтобы проверять кандидатов на off-target: не порежет ли Cas9 что-нибудь лишнее в геноме. Тестировать будем на гене CCR5 — том самом, который отредактировал китайский учёный Хэ Цзянькуй в скандальном эксперименте 2018 года.
https://habr.com/ru/articles/982876/
#днк #cas9 #crispr #генетика #генная_инженерия #биоинформатика #биоинженерия #анализ_днк
-
Кроим ДНК на Python: CRISPR gRNA finder, Часть I: Введение и базовый поиск
Несколько лет назад я наткнулся на статью про CRISPR‑Cas9 и домашние биолаборатории — люди буквально у себя дома экспериментировали с редактированием генов. Я бэкенд‑разработчик, биологию последний раз открывал в школе, но желание разобраться никуда не делось. В этой статье разберёмся, как работает CRISPR на минимальном уровне, и напишем CLI‑утилиту на Python для поиска потенциальных guide RNA — «наводчиков» для молекулярных ножниц Cas9.
https://habr.com/ru/articles/982664/
#биоинформатика #биоинженерия #cas9 #crispr #днк #анализ_днк #чайникчайнику
-
Острая генетическая недостаточность: о перспективах модификации генома для колонизации космоса
Мы незаметно преодолеваем рубеж, после которого редактирование человеческого генома, в том числе, зародышевой линии становится не только технически осуществимым, но и коммерчески интересным . Я не буду вдаваться в глубокую социально-расовую подоплёку этого процесса, предложу вам поговорить о той сфере, в которой без коррекции человека на уровне генома, по-видимому, не обойтись. Речь о долговременных пилотируемых космических экспедициях. Эволюция позволила нашему виду не только приспособиться к обитанию во всех климатических поясах Земли, но и в значительной степени изменить планету для нашего комфорта и безопасного обитания на ней. При этом все известные планеты практически непригодны для жизнедеятельности (лишь освоение Луны и Марса кажется осуществимым в отдалённой перспективе «вахтовым методом»). Как я рассказывал ранее в одной из статей, терраформирование сейчас можно рассматривать только как научную фантастику , а не как инженерный проект (правда, примерно через полгода на сайте Prokosmos вышла более оптимистичная статья о терраформировании Марса — также рекомендую её почитать). Будем исходить из того, что сейчас космоформировать космонавта гораздо реальнее, чем терраформировать его будущую среду обитания. Под катом – коротко о том, как осваивается этот научный фронтир. Мы поговорим прежде всего о потенциальном совершенствовании человека для долгосрочной экспедиции на Марс.
-
Острая генетическая недостаточность: о перспективах модификации генома для колонизации космоса
Мы незаметно преодолеваем рубеж, после которого редактирование человеческого генома, в том числе, зародышевой линии становится не только технически осуществимым, но и коммерчески интересным . Я не буду вдаваться в глубокую социально-расовую подоплёку этого процесса, предложу вам поговорить о той сфере, в которой без коррекции человека на уровне генома, по-видимому, не обойтись. Речь о долговременных пилотируемых космических экспедициях. Эволюция позволила нашему виду не только приспособиться к обитанию во всех климатических поясах Земли, но и в значительной степени изменить планету для нашего комфорта и безопасного обитания на ней. При этом все известные планеты практически непригодны для жизнедеятельности (лишь освоение Луны и Марса кажется осуществимым в отдалённой перспективе «вахтовым методом»). Как я рассказывал ранее в одной из статей, терраформирование сейчас можно рассматривать только как научную фантастику , а не как инженерный проект (правда, примерно через полгода на сайте Prokosmos вышла более оптимистичная статья о терраформировании Марса — также рекомендую её почитать). Будем исходить из того, что сейчас космоформировать космонавта гораздо реальнее, чем терраформировать его будущую среду обитания. Под катом – коротко о том, как осваивается этот научный фронтир. Мы поговорим прежде всего о потенциальном совершенствовании человека для долгосрочной экспедиции на Марс.
-
Острая генетическая недостаточность: о перспективах модификации генома для колонизации космоса
Мы незаметно преодолеваем рубеж, после которого редактирование человеческого генома, в том числе, зародышевой линии становится не только технически осуществимым, но и коммерчески интересным . Я не буду вдаваться в глубокую социально-расовую подоплёку этого процесса, предложу вам поговорить о той сфере, в которой без коррекции человека на уровне генома, по-видимому, не обойтись. Речь о долговременных пилотируемых космических экспедициях. Эволюция позволила нашему виду не только приспособиться к обитанию во всех климатических поясах Земли, но и в значительной степени изменить планету для нашего комфорта и безопасного обитания на ней. При этом все известные планеты практически непригодны для жизнедеятельности (лишь освоение Луны и Марса кажется осуществимым в отдалённой перспективе «вахтовым методом»). Как я рассказывал ранее в одной из статей, терраформирование сейчас можно рассматривать только как научную фантастику , а не как инженерный проект (правда, примерно через полгода на сайте Prokosmos вышла более оптимистичная статья о терраформировании Марса — также рекомендую её почитать). Будем исходить из того, что сейчас космоформировать космонавта гораздо реальнее, чем терраформировать его будущую среду обитания. Под катом – коротко о том, как осваивается этот научный фронтир. Мы поговорим прежде всего о потенциальном совершенствовании человека для долгосрочной экспедиции на Марс.
-
Острая генетическая недостаточность: о перспективах модификации генома для колонизации космоса
Мы незаметно преодолеваем рубеж, после которого редактирование человеческого генома, в том числе, зародышевой линии становится не только технически осуществимым, но и коммерчески интересным . Я не буду вдаваться в глубокую социально-расовую подоплёку этого процесса, предложу вам поговорить о той сфере, в которой без коррекции человека на уровне генома, по-видимому, не обойтись. Речь о долговременных пилотируемых космических экспедициях. Эволюция позволила нашему виду не только приспособиться к обитанию во всех климатических поясах Земли, но и в значительной степени изменить планету для нашего комфорта и безопасного обитания на ней. При этом все известные планеты практически непригодны для жизнедеятельности (лишь освоение Луны и Марса кажется осуществимым в отдалённой перспективе «вахтовым методом»). Как я рассказывал ранее в одной из статей, терраформирование сейчас можно рассматривать только как научную фантастику , а не как инженерный проект (правда, примерно через полгода на сайте Prokosmos вышла более оптимистичная статья о терраформировании Марса — также рекомендую её почитать). Будем исходить из того, что сейчас космоформировать космонавта гораздо реальнее, чем терраформировать его будущую среду обитания. Под катом – коротко о том, как осваивается этот научный фронтир. Мы поговорим прежде всего о потенциальном совершенствовании человека для долгосрочной экспедиции на Марс.
-
Компания Atlas Data Storage представила первое в мире хранилище данных на основе ДНК
https://www.unian.net/science/chto-delayut-s-dnk-kompaniya-atlas-data-storage-predstavila-hranilishche-dannyh-na-osnove-dnk-13219086.html
#unian #ДНК #Atlas_Data_Storage #хранилище #хранилищеданных -
Компания Atlas Data Storage представила первое в мире хранилище данных на основе ДНК
https://www.unian.net/science/chto-delayut-s-dnk-kompaniya-atlas-data-storage-predstavila-hranilishche-dannyh-na-osnove-dnk-13219086.html
#unian #ДНК #Atlas_Data_Storage #хранилище #хранилищеданных -
Компания Atlas Data Storage представила первое в мире хранилище данных на основе ДНК
https://www.unian.net/science/chto-delayut-s-dnk-kompaniya-atlas-data-storage-predstavila-hranilishche-dannyh-na-osnove-dnk-13219086.html
#unian #ДНК #Atlas_Data_Storage #хранилище #хранилищеданных -
Погибший мамонтенок раскрыл свои тайны: ученые прочитали его РНК спустя 39 тысяч лет
Когда в 2010 году в сибирской мерзлоте нашли небольшого мамонтенка Юку, находку восприняли как огромную удачу. Ткани животного сохранились почти идеально: на теле сохранились царапины, шерсть лежала плотным слоем, мышцы практически не утратили структуру. 15 лет спустя стало ясно, что эта находка куда важнее, чем предполагали вначале. Группа исследователей из Стокгольмского университета сообщила о выделении из тканей Юки древней РНК — молекул, которые редко переживают даже десятилетия, не говоря о десятках тысяч лет. Работа исследователей показала, как современные методы позволяют выйти за рамки привычного анализа ДНК и получить данные о клеточной активности давно исчезнувшего животного.
https://habr.com/ru/companies/ru_mts/articles/968938/
#палеогенетика #РНК #днк #мамонтенок_юка #секвенирование #мамонты_клёвые
-
Погибший мамонтенок раскрыл свои тайны: ученые прочитали его РНК спустя 39 тысяч лет
Когда в 2010 году в сибирской мерзлоте нашли небольшого мамонтенка Юку, находку восприняли как огромную удачу. Ткани животного сохранились почти идеально: на теле сохранились царапины, шерсть лежала плотным слоем, мышцы практически не утратили структуру. 15 лет спустя стало ясно, что эта находка куда важнее, чем предполагали вначале. Группа исследователей из Стокгольмского университета сообщила о выделении из тканей Юки древней РНК — молекул, которые редко переживают даже десятилетия, не говоря о десятках тысяч лет. Работа исследователей показала, как современные методы позволяют выйти за рамки привычного анализа ДНК и получить данные о клеточной активности давно исчезнувшего животного.
https://habr.com/ru/companies/ru_mts/articles/968938/
#палеогенетика #РНК #днк #мамонтенок_юка #секвенирование #мамонты_клёвые
-
Погибший мамонтенок раскрыл свои тайны: ученые прочитали его РНК спустя 39 тысяч лет
Когда в 2010 году в сибирской мерзлоте нашли небольшого мамонтенка Юку, находку восприняли как огромную удачу. Ткани животного сохранились почти идеально: на теле сохранились царапины, шерсть лежала плотным слоем, мышцы практически не утратили структуру. 15 лет спустя стало ясно, что эта находка куда важнее, чем предполагали вначале. Группа исследователей из Стокгольмского университета сообщила о выделении из тканей Юки древней РНК — молекул, которые редко переживают даже десятилетия, не говоря о десятках тысяч лет. Работа исследователей показала, как современные методы позволяют выйти за рамки привычного анализа ДНК и получить данные о клеточной активности давно исчезнувшего животного.
https://habr.com/ru/companies/ru_mts/articles/968938/
#палеогенетика #РНК #днк #мамонтенок_юка #секвенирование #мамонты_клёвые