#rstan — Public Fediverse posts
Live and recent posts from across the Fediverse tagged #rstan, aggregated by home.social.
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okay #rstats #rstan #stan hivemind:
do you have any examples of Stan models (incl #brms) running in production, especially attached to Shiny apps where responsiveness/compute time is pretty important (and interfacing with non-quant people)?
What tricks do you use?
Please send blogs, packages, repos, anecdotes! :)
Please do not send: suggestions that I use an empirical Bayes/frequentist framework. I know how to do that :)
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Heureux d'annoncer la publication dans @PeerCommunityJournal de notre analyse de la dynamique du #MicrobioteVaginal.
Ces travaux sont issus de l'étude #PAPCLEAR promue par le #CHU_Montpellier et financée par l' @ERC_Research, qui représente l'un des suivis les plus longs à ce jour.
Le magnifique modèle statistique (tout en #RStan) a été réalisé par @tsukushi_kamiya et le séquençage #16S de plus de 2000 échantillons réalisé dans le laboratoire de Jacques Ravel.
https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.527/
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Heureux d'annoncer la publication dans @PeerCommunityJournal de notre analyse de la dynamique du #MicrobioteVaginal.
Ces travaux sont issus de l'étude #PAPCLEAR promue par le #CHU_Montpellier et financée par l' @ERC_Research, qui représente l'un des suivis les plus longs à ce jour.
Le magnifique modèle statistique (tout en #RStan) a été réalisé par @tsukushi_kamiya et le séquençage #16S de plus de 2000 échantillons réalisé dans le laboratoire de Jacques Ravel.
https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.527/
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Heureux d'annoncer la publication dans @PeerCommunityJournal de notre analyse de la dynamique du #MicrobioteVaginal.
Ces travaux sont issus de l'étude #PAPCLEAR promue par le #CHU_Montpellier et financée par l' @ERC_Research, qui représente l'un des suivis les plus longs à ce jour.
Le magnifique modèle statistique (tout en #RStan) a été réalisé par @tsukushi_kamiya et le séquençage #16S de plus de 2000 échantillons réalisé dans le laboratoire de Jacques Ravel.
https://peercommunityjournal.org/articles/10.24072/pcjournal.527/
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Обзор библиотеки Stan в R
Приветствую! Stan - это библиотека на C++, предназначенная для байесовского моделирования и вывода. Она использует сэмплер NUTS, чтобы создавать апостериорные симуляции модели, основываясь на заданных пользователем моделях и данных. Так же Stan может использовать алгоритм оптимизации LBFGS для максимизации целевой функции, к примеру как логарифмическое правдоподобие . Для облегчения работы с Stan из языка программирования R доступен пакет rstan , который предоставляет интерфейс R для Stan. Сегодня мы и рассмотрим этот пакет.
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Trying to work out the simplest way to find out if my team’s Windows permissions allow them to compile Stan models. Have assumed that compiling models is like compiling packages (is that a good assumption?)
I've come up with:
1. Install Rtools (cran.ma.imperial.ac.uk/bin/windows/Rtools)
2. > install.packages("devtools")
3. Find a small, intriguing package: BRRR
4. > devtools::install_github("brooke-watson/BRRR", build = TRUE)
#Rstats #R #Rstan -
You've heard about Stan and want to learn some more? Maybe you're about to step into the Bayesian paradigm and don't know where to start 🤔
In this week's blog post, we'll take a look what you can do with #Stan and draw comparisons to #JAGS!
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My #Rstats package for creating interactive #bayesian visualizations is finally available on CRAN :https://ignacio82.github.io/vizdraws/
The package can probably use better documentation, additional features, and it may have some bugs. However, I thought that the best way to keep improving it was to push it.