#геномика — Public Fediverse posts

Пиявка, криптобиоз и магистратура: история одного исследования

Клим, расскажи, что такое криптобиоз и почему это важно? Криптобиоз — это состояние, при котором организм практически полностью замедляет или временно останавливает видимые жизненные процессы, чтобы пережить крайне неблагоприятные условия среды. У разных организмов такие условия могут быть разными: это может быть высушивание, замораживание, дефицит кислорода или другие экстремальные воздействия. Именно поэтому криптобиоз особенно интересен: он показывает, что в природе уже существуют механизмы, позволяющие живым системам выдерживать то, что для большинства клеток и организмов оказалось бы разрушительным. К таким организмам относятся, например, тихоходки, коловратки, некоторые нематоды и артемия. Конечно, это не значит, что механизмы, работающие у таких организмов, можно напрямую перенести на клетки человека, ткани или органы. Между фундаментальным пониманием и реальным медицинским применением всегда пролегает большая дистанция. Но на природные примеры людям нужно смотреть в первую очередь: они показывают, что такие решения в принципе возможны, а значит, могут подсказать направление поиска, новые молекулярные мишени и биоинспирированные подходы в криобиологии, биобанкировании и других областях, где нужно сохранять живой материал.

https://habr.com/ru/companies/mipt_digital/articles/1035438/

#криптобиоз #пиявка #сохранение_биологических_систем #трансплантология #ЭКО #биобанкирование #криобиология #геномика #транскриптомика #биоинформатика

AI-ученые уже здесь: Большой тур по LLM, которые меняют фундаментальную науку

Искусственный интеллект превращается из инструмента в полноценного партнера ученого. В этом большом обзоре мы рассмотрим, как LLM вроде AlphaFold 3, TxGemma и ChemLLM совершают революцию в биологии, медицине, химии и материаловедении, переходя от анализа данных к проектированию будущего.

https://habr.com/ru/articles/938638/

#llm #ai_в_науке #научные_LLM #AlphaFold_3 #TxGemma #разработка_лекарств #геномика #вычислительная_химия

Клетка ХV. Картирование типов клеток

Изучение человека в настоящее время проводится множеством разных наук известными и новыми методами и весьма интенсивно. В мире осуществляются многомиллиардные исследовательские проекты. Изучаются геном, протеом, транскриптом человека, мозг человека и другие составляющие организма. Люди поняли, что пришло время серьезно взяться за изучение самих себя, своего организма, состоящего из триллионов взаимосвязанных клеток. Сложность организма, обеспечивается, однако, не только наличием большого количества выполняющих разные функции клеток, но также их взаимодействием на уровне межклеточной среды, тканей и даже целых органов. В рамках проекта Атлас клеток человека (Human Cell Atlas) создан такой атлас и уже используется. Он включил данные, полученные сразу несколькими международными исследовательскими коллективами. Развитие современных технологий секвенирования РНК отдельных клеток (scRNA-seg) показало, что типы клеток человеческого организма очень многообразны, сейчас насчитываются сотни различных типов. В предлагаемой работе приводится характеристика транскриптома, в рамках которого осуществляется картирование клеток, его структура и динамичность. Транскриптом называют молекулу РНК, образующуюся в результате транскрипции (экспрессии соответствующего гена или участка ДНК). Примерами транскриптов являются: матричные РНК (мРНК). В статье приводится характеристика транскриптома, его структура и динамичность. Методы исследования транскриптов. Кодирующие и некодирующие РНК, их классификация, микро РНК, siРНК, нано-РНК, сборка транскриптов кратко рассматриваются в публикации. Цель публикации в первую очередь образовательная, познавательная, популяризация науки, а также стремление привлечь в ряды исследователей, в науку приток новых молодых умов, вызвать в таких умах стремление к поиску ответов на возникающие вопросы. Масштабность темы требует ввести разумные ограничения на излагаемый материал после краткого панорамного ее рассмотрения.

https://habr.com/ru/articles/803029/

#клетка #геном #геномика #транскриптом #протеом #протеомика #метаболиты #секвенирование #сплайсинг #рнк

Клетка ХV. Картирование типов клеток

Изучение человека в настоящее время проводится множеством разных наук известными и новыми методами и весьма интенсивно. В мире осуществляются многомиллиардные исследовательские проекты. Изучаются геном, протеом, транскриптом человека, мозг человека и другие составляющие организма. Люди поняли, что пришло время серьезно взяться за изучение самих себя, своего организма, состоящего из триллионов взаимосвязанных клеток. Сложность организма, обеспечивается, однако, не только наличием большого количества выполняющих разные функции клеток, но также их взаимодействием на уровне межклеточной среды, тканей и даже целых органов. В рамках проекта Атлас клеток человека (Human Cell Atlas) создан такой атлас и уже используется. Он включил данные, полученные сразу несколькими международными исследовательскими коллективами. Развитие современных технологий секвенирования РНК отдельных клеток (scRNA-seg) показало, что типы клеток человеческого организма очень многообразны, сейчас насчитываются сотни различных типов. В предлагаемой работе приводится характеристика транскриптома, в рамках которого осуществляется картирование клеток, его структура и динамичность. Транскриптом называют молекулу РНК, образующуюся в результате транскрипции (экспрессии соответствующего гена или участка ДНК). Примерами транскриптов являются: матричные РНК (мРНК). В статье приводится характеристика транскриптома, его структура и динамичность. Методы исследования транскриптов. Кодирующие и некодирующие РНК, их классификация, микро РНК, siРНК, нано-РНК, сборка транскриптов кратко рассматриваются в публикации. Цель публикации в первую очередь образовательная, познавательная, популяризация науки, а также стремление привлечь в ряды исследователей, в науку приток новых молодых умов, вызвать в таких умах стремление к поиску ответов на возникающие вопросы. Масштабность темы требует ввести разумные ограничения на излагаемый материал после краткого панорамного ее рассмотрения.

https://habr.com/ru/articles/803029/

#клетка #геном #геномика #транскриптом #протеом #протеомика #метаболиты #секвенирование #сплайсинг #рнк

Клетка ХV. Картирование типов клеток

Изучение человека в настоящее время проводится множеством разных наук известными и новыми методами и весьма интенсивно. В мире осуществляются многомиллиардные исследовательские проекты. Изучаются геном, протеом, транскриптом человека, мозг человека и другие составляющие организма. Люди поняли, что пришло время серьезно взяться за изучение самих себя, своего организма, состоящего из триллионов взаимосвязанных клеток. Сложность организма, обеспечивается, однако, не только наличием большого количества выполняющих разные функции клеток, но также их взаимодействием на уровне межклеточной среды, тканей и даже целых органов. В рамках проекта Атлас клеток человека (Human Cell Atlas) создан такой атлас и уже используется. Он включил данные, полученные сразу несколькими международными исследовательскими коллективами. Развитие современных технологий секвенирования РНК отдельных клеток (scRNA-seg) показало, что типы клеток человеческого организма очень многообразны, сейчас насчитываются сотни различных типов. В предлагаемой работе приводится характеристика транскриптома, в рамках которого осуществляется картирование клеток, его структура и динамичность. Транскриптом называют молекулу РНК, образующуюся в результате транскрипции (экспрессии соответствующего гена или участка ДНК). Примерами транскриптов являются: матричные РНК (мРНК). В статье приводится характеристика транскриптома, его структура и динамичность. Методы исследования транскриптов. Кодирующие и некодирующие РНК, их классификация, микро РНК, siРНК, нано-РНК, сборка транскриптов кратко рассматриваются в публикации. Цель публикации в первую очередь образовательная, познавательная, популяризация науки, а также стремление привлечь в ряды исследователей, в науку приток новых молодых умов, вызвать в таких умах стремление к поиску ответов на возникающие вопросы. Масштабность темы требует ввести разумные ограничения на излагаемый материал после краткого панорамного ее рассмотрения.

https://habr.com/ru/articles/803029/

#клетка #геном #геномика #транскриптом #протеом #протеомика #метаболиты #секвенирование #сплайсинг #рнк