home.social

#bwa — Public Fediverse posts

Live and recent posts from across the Fediverse tagged #bwa, aggregated by home.social.

fetched live
  1. "Minibwa is the new bwa-mem "

    lh3.github.io/2026/07/04/minib

    Minibwa is a fresh start without the baggage of backward compatibility. Combining the advantages of bwa-mem and minimap2, it works for long reads and finds much more long gaps in >500bp SBX reads than bwa-mem. With better engineering and parameter tuning, minibwa is also a few times as fast as bwa-mem.

    #bwa #bioinformatics

  2. "Minibwa is the new bwa-mem "

    lh3.github.io/2026/07/04/minib

    Minibwa is a fresh start without the baggage of backward compatibility. Combining the advantages of bwa-mem and minimap2, it works for long reads and finds much more long gaps in >500bp SBX reads than bwa-mem. With better engineering and parameter tuning, minibwa is also a few times as fast as bwa-mem.

    #bwa #bioinformatics

  3. #bwa upgrade: Fast genomic read alignment with minibwa
    arxiv.org/abs/2606.15357
    "It produces equivalent or slightly improved small variant calls, and more importantly, enables long-read alignment and doubles performance over BWA- MEM2."

    github.com/lh3/minibwa
    Limitations: Minibwa does not work with noisy long reads or spliced RNA-seq reads.

    #bioinformatics #paper

  4. #bwa upgrade: Fast genomic read alignment with minibwa
    arxiv.org/abs/2606.15357
    "It produces equivalent or slightly improved small variant calls, and more importantly, enables long-read alignment and doubles performance over BWA- MEM2."

    github.com/lh3/minibwa
    Limitations: Minibwa does not work with noisy long reads or spliced RNA-seq reads.

    #bioinformatics #paper

  5. github.com/lh3/minibwa

    Successor of bwa-mem for short-read alignment

    "Minibwa aligns short reads against a reference genome. It is the successor of bwa-mem with a different algorithm. "

    #bioinformatics #alignment #bwa

  6. github.com/lh3/minibwa

    Successor of bwa-mem for short-read alignment

    "Minibwa aligns short reads against a reference genome. It is the successor of bwa-mem with a different algorithm. "

    #bioinformatics #alignment #bwa

  7. Burkina Azza (BF) • Tunglleysa (IS) @ Ada • Svmerki • 26.06.26

    🗓️ Start: 26 czerwca 2026 19:00
    ⏳ End: 26 czerwca 2026 22:00
    📍 Location: ADA Puławska, Puławska 37, 02-508, Warszawa, Poland

    Svmerki serdecznie zapraszają na niezwykły koncert podczas którego muzycy z dalekiego półdniowego Burkina Faso zagrają obok z muzykami z dalekiej północnej Islandii! 🌞❄ Już 26 czerwca na Adzie Puławskiej wystąpi zespół 𝗕𝘂𝗿𝗸𝗶𝗻𝗮 𝗔𝘇𝘇𝗮 reprezentujący tradycyjną muzykę swojego regionu z wpływami współczesnej muzyki afrykańskiej oraz islandzki ambientowy duet 𝗧𝘂𝗻𝗴𝗹𝗹𝗲𝘆𝘀𝗮 muzyka którego przekracza granice poprzez improwizację z gitarą, elektroniką i nagraniami terenowymi!

    ·

    Zespół 𝗕𝘂𝗿𝗸𝗶𝗻𝗮 𝗔𝘇𝘇𝗮 tworzy pięciu braci pochodzących z Nayeriny w regionie Djibasso, wywodzących się z linii muzyków balafonistów i perkusistów zwanych griotami, często określanych jako „żywe archiwum tradycji ludowych”. Dzieci ludu Bwa, ich muzyka jest odzwierciedleniem ich głębokiej miłości do kultury, tradycji i życia, przy jednoczesnym czerpaniu z wpływów współczesnej muzyki afrykańskiej.

    https://burkinaazza.bandcamp.com
    https://youtube.com/watch?v=VBQ6hgk3vYU
    https://instagram.com/burkinaazza__officielle
    https://facebook.com/troupeburkinaazza

    Mimo że są balafonistami z pokolenia na pokolenie, używają też innych instrumentów perkusyjnych (djembé, bara, tama, doum) a także instrumentów strunowych (kora, n’goni) i kontynuują tradycję muzyki przodków, przekazywanej z ojca na syna.

    ·

    𝗧𝘂𝗻𝗴𝗹𝗹𝗲𝘆𝘀𝗮 to duet z Reykjaviku, składający się z Pana (takie imię) Thorarensena i Thorkella Atlasona. Kładąc nacisk na ambient i eksperymentalne pejzaże dźwiękowe, ich muzyka przekracza granice poprzez improwizację z gitarą, elektroniką i nagraniami terenowymi.

    https://spaceodyssey.bandcamp.com/album/tunglleysa-orkell-atlason-pan-thorarensen
    https://youtube.com/watch?v=lR-tWj8D4II
    https://instagram.com/tunglleysa
    https://facebook.com/tunglleysa

    Thorkell Atlason to islandzki kompozytor i gitarzysta. Studiował grę na gitarze klasycznej w Reykjaviku, a kompozycję w Reykjaviku i Rotterdamie. Jego utwory były szeroko wykonywane za granicą, w tym na Islandii.

    Pan Thorarensen to muzyk i producent z Reykjaviku. Pan podróżował i prezentował swoją twórczość na całym świecie, występując na wielu festiwalach. Od dawna jest katalizatorem muzyki elektronicznej na Islandii. Siedemnaście lat temu założył i zorganizował Extreme Chill, który jest obecnie najdłużej działającym festiwalem na Islandii, skupiającym się na muzyce eksperymentalnej i sztuce dźwiękowej.

    ·

    Partnerki i partnerzy:
    AdaPulawska.org
    AvantArt.pl
    Bloody Cucumber
    BolingoArt.com
    Glissando.pl
    NaOrzezach.pl
    Podróżnych Ugościć
    Radiowe Centrum Kultury Ludowej
    Shoegazepl
    Sztukmix.pl
    Uknowme-records.com
    10fuckingstars.wordpress.com

    ·

    GDZIE: Ada Puławska / Puławska 37, Warszawa 02-508.

    KIEDY: 26 czerwca 2026 r. Bramka 19:00, koncerty 20:00.
    50

    ·

    Więcej koncertów od Svmerki ✦

    31.05 • La Casa Fantom (NOR) • Nesen (LV) @ Mechanik
    https://facebook.com/events/913493661563579

    10.07 • Able Noise (NL/GR) @ TBA

    adapulawska.org/wydarzenie/bur

  8. Burkina Azza (BF) • Tunglleysa (IS) @ Ada • Svmerki • 26.06.26

    🗓️ Start: 26 czerwca 2026 19:00
    ⏳ End: 26 czerwca 2026 22:00
    📍 Location: ADA Puławska, Puławska 37, 02-508, Warszawa, Poland

    Svmerki serdecznie zapraszają na niezwykły koncert podczas którego muzycy z dalekiego półdniowego Burkina Faso zagrają obok z muzykami z dalekiej północnej Islandii! 🌞❄ Już 26 czerwca na Adzie Puławskiej wystąpi zespół 𝗕𝘂𝗿𝗸𝗶𝗻𝗮 𝗔𝘇𝘇𝗮 reprezentujący tradycyjną muzykę swojego regionu z wpływami współczesnej muzyki afrykańskiej oraz islandzki ambientowy duet 𝗧𝘂𝗻𝗴𝗹𝗹𝗲𝘆𝘀𝗮 muzyka którego przekracza granice poprzez improwizację z gitarą, elektroniką i nagraniami terenowymi!

    ·

    Zespół 𝗕𝘂𝗿𝗸𝗶𝗻𝗮 𝗔𝘇𝘇𝗮 tworzy pięciu braci pochodzących z Nayeriny w regionie Djibasso, wywodzących się z linii muzyków balafonistów i perkusistów zwanych griotami, często określanych jako „żywe archiwum tradycji ludowych”. Dzieci ludu Bwa, ich muzyka jest odzwierciedleniem ich głębokiej miłości do kultury, tradycji i życia, przy jednoczesnym czerpaniu z wpływów współczesnej muzyki afrykańskiej.

    https://burkinaazza.bandcamp.com
    https://youtube.com/watch?v=VBQ6hgk3vYU
    https://instagram.com/burkinaazza__officielle
    https://facebook.com/troupeburkinaazza

    Mimo że są balafonistami z pokolenia na pokolenie, używają też innych instrumentów perkusyjnych (djembé, bara, tama, doum) a także instrumentów strunowych (kora, n’goni) i kontynuują tradycję muzyki przodków, przekazywanej z ojca na syna.

    ·

    𝗧𝘂𝗻𝗴𝗹𝗹𝗲𝘆𝘀𝗮 to duet z Reykjaviku, składający się z Pana (takie imię) Thorarensena i Thorkella Atlasona. Kładąc nacisk na ambient i eksperymentalne pejzaże dźwiękowe, ich muzyka przekracza granice poprzez improwizację z gitarą, elektroniką i nagraniami terenowymi.

    https://spaceodyssey.bandcamp.com/album/tunglleysa-orkell-atlason-pan-thorarensen
    https://youtube.com/watch?v=lR-tWj8D4II
    https://instagram.com/tunglleysa
    https://facebook.com/tunglleysa

    Thorkell Atlason to islandzki kompozytor i gitarzysta. Studiował grę na gitarze klasycznej w Reykjaviku, a kompozycję w Reykjaviku i Rotterdamie. Jego utwory były szeroko wykonywane za granicą, w tym na Islandii.

    Pan Thorarensen to muzyk i producent z Reykjaviku. Pan podróżował i prezentował swoją twórczość na całym świecie, występując na wielu festiwalach. Od dawna jest katalizatorem muzyki elektronicznej na Islandii. Siedemnaście lat temu założył i zorganizował Extreme Chill, który jest obecnie najdłużej działającym festiwalem na Islandii, skupiającym się na muzyce eksperymentalnej i sztuce dźwiękowej.

    ·

    Partnerki i partnerzy:
    AdaPulawska.org
    AvantArt.pl
    Bloody Cucumber
    BolingoArt.com
    Glissando.pl
    NaOrzezach.pl
    Podróżnych Ugościć
    Radiowe Centrum Kultury Ludowej
    Shoegazepl
    Sztukmix.pl
    Uknowme-records.com
    10fuckingstars.wordpress.com

    ·

    GDZIE: Ada Puławska / Puławska 37, Warszawa 02-508.

    KIEDY: 26 czerwca 2026 r. Bramka 19:00, koncerty 20:00.
    50

    ·

    Więcej koncertów od Svmerki ✦

    31.05 • La Casa Fantom (NOR) • Nesen (LV) @ Mechanik
    https://facebook.com/events/913493661563579

    10.07 • Able Noise (NL/GR) @ TBA

    adapulawska.org/wydarzenie/bur

  9. Wer daran teilgenommen hat: Log einsenden nicht vergessen!

    Die Frist für den #BWA endet diesen Mittwoch!

  10. Wer daran teilgenommen hat: Log einsenden nicht vergessen!

    Die Frist für den #BWA endet diesen Mittwoch!

  11. Am Vormittag des Ostersamstags ist wieder der Contest "Baden-Württemberg Aktivität"

    Also, wem noch A oder P im Logbuch fehlt, hier ist die Gelegenheit:

    2025-04-19 07:00 - 12:00 UTC

    Zeiten, Band und Mode beachten:

    darc.de/der-club/distrikte/a/o

    #BWA2025 #BWA #BadenWürttembergAktivität #savethedate

  12. Am Vormittag des Ostersamstags ist wieder der Contest "Baden-Württemberg Aktivität"

    Also, wem noch A oder P im Logbuch fehlt, hier ist die Gelegenheit:

    2025-04-19 07:00 - 12:00 UTC

    Zeiten, Band und Mode beachten:

    darc.de/der-club/distrikte/a/o

    #BWA2025 #BWA #BadenWürttembergAktivität #savethedate

  13. BorgWarner (#BWA) exceeds Q1 expectations: EPS beats forecasts at $1.03 compared to the expected $0.87, while revenue also surpasses expectations at $3.6B versus the forecasted $3.51B. #BorgWarner #earnings #stocks 🚘💼

  14. BorgWarner (#BWA) exceeds Q1 expectations: EPS beats forecasts at $1.03 compared to the expected $0.87, while revenue also surpasses expectations at $3.6B versus the forecasted $3.51B. #BorgWarner #earnings #stocks 🚘💼

  15. I was given a BAM. I see the following tags in the SAM:

    'de:f:0.0067 rl:i:0 cm:i:19 nn:i:0 tp:A:P ms:i:288'

    #GATK HaplotypeCaller crashed because of those tags. ( gatk.broadinstitute.org/hc/en- )

    The only tools used (header/@PG) are bwa: 7.15-r1142-dirty and MarkDuplicates.
    which tool added those tags ?

    #sam #bam #bwa

  16. I was given a BAM. I see the following tags in the SAM:

    'de:f:0.0067 rl:i:0 cm:i:19 nn:i:0 tp:A:P ms:i:288'

    #GATK HaplotypeCaller crashed because of those tags. ( gatk.broadinstitute.org/hc/en- )

    The only tools used (header/@PG) are bwa: 7.15-r1142-dirty and MarkDuplicates.
    which tool added those tags ?

    #sam #bam #bwa