#variantsofsarscov2 — Public Fediverse posts

▶️Orf3a:A54V est le retour d'une mutation de la souche Wuhan arrivée très tôt en 2020. Orf3a, propre aux SARS, joue plusieurs rôles, dont un pathogène inflammatoire (cytokine storm).

Voir réapparaître des mutations de début 2020 dessus n'est jamais rassurant.

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▶️Les mutations en 852-859 (fusion peptide proximal région) S2 de Spike sont convergentes depuis peu, mais apparaissent aussi dans des mutations d'immunodeprimés chroniques. Leur avantage peut-être sur la fusion cellulaire.

Ce variant progresse rapidement.

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THREAD nouveau variant

BQ.1.25 devient brutalement intéressant (Amerique, Australie)

BQ.1.25▶️BQ.1 + S:R346T
BQ.1.25.1▶️BQ.1.25 + S:L858I + ORF3a:A54V

▶️S:R346T l'amène au niveau de BQ.1.1 en échappement immunitaire.

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Nouveau variant :

Sur la branche BA.5.1.25* :

DJ.1.3▶️DJ.1 + S:N460K + ORF1ab:T6098A

4 mutations d'échappement immunitaire ++
2 mutations d'échappement immunitaire +

▶️ORF1ab:T6098A : Mutation inédite dans l'ExoN de NSP14, système de correction d'erreurs à la réplication qui gène la recherche d'antiviraux

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Rather than having evolved in an immunocompromised person in South Africa as suspected, Omicron seems to have evolved in steps while circulating in West Africa during summer 2021 before exploding across the south that autumn.
https://www.science.org/doi/10.1126/science.add8737

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