#dicom — Public Fediverse posts
Live and recent posts from across the Fediverse tagged #dicom, aggregated by home.social.
-
Сшивка кадров с микроскопа: как собрать большое изображение из видео
Рассматривать предметный образец под микроскопом — всё равно что пытаться увидеть концертный зал через замочную скважину: в поле зрения попадает только небольшой фрагмент, а общей картины не видно. Поэтому предметное стекло постепенно перемещают под камерой, а система записывает видео и собирает отдельные кадры в одно большое изображение, которое можно сохранить и использовать для исследования. Сделать это простым наложением кадров нельзя: во время движения они могут смазываться, освещение меняется, а похожие участки легко перепутать. Мы сравнили несколько подходов к совмещению соседних кадров.
https://habr.com/ru/articles/1067168/
#сшивка_изображений #обработка_изображений #компьютерное_зрение #микроскопия #OpenCV #оптический_поток #фазовая_корреляция #видеопоток #DICOM #GeoTIFF
-
Se il problema che vi impedisce di passare a GNU\Linux sono le radiografie del dottore, distribuite (su CD? 📀) in formato #dicom e simpatici software Mac e Windows.
Non avete scuse, perché per GNU :gnu: ce ne sono disponibili più di tre!
Dobbiamo sempre far da soli, mai nessuno che ci aiuta in modo solidale. Questa è discriminazione!
https://askubuntu.com/questions/909692/is-there-a-way-to-open-dicom-files -
A new milestone for DICOM-rs has finally arrived! DICOM-rs is an implementation of the DICOM standard for the next generation of medical imaging systems.
Version 0.10.0 comes with dependency updates, an updated Rust compiler version requirement, a revised support for DICOM over TLS, a Move SCU tool, and support for generic extended negotiation at the upper layer protocol, not to mention a bunch of fixes and improvements.
https://github.com/Enet4/dicom-rs/releases/tag/v0.10.0
May your goose be always valued.
-
Как мы перестали молиться на AI и собрали параноидальный конвейер для МРТ (с открытым кодом)
На каждой второй конференции по медицинскому AI звучит один и тот же сценарий: «Дообучим мультимодальную модель, скормим ей DICOM, и она сама выдаст диагноз». На практике, когда этот скрипт пытается попасть в реальную клинику, начинаются неожиданности. OOM на GPU, врачи не понимают, где галлюцинация модели, а где финальный отчёт, двухгигабайтные NIfTI-исследования рвут таймауты балансировщика. Я какое-то время тоже думала, что главное — это модель. А потом пересмотрела собственный код. У меня уже есть MRI Second Opinion . Но это не нейросеть. Это контур с доменной моделью, конвейером приёма данных, циклом обработки, обязательным врачебным рецензированием, финализацией и отдельным репозиторием с открытым кодом . В медицинском IT модель — не главная проблема. Главная проблема — чтобы между входом и выходом ничего не потерялось и не сломалось.
https://habr.com/ru/articles/1022436/
#mri #dicom #архитектура #typescript #open_source #fda #event_sourcing #медицинское_по #machine_learning #pipeline
-
Y yo usando mi lap para ver estudios #DICOM sin calibrar nada. Como salvaje.
No como el señorito “gastar una fortuna en un monitor exclusivo”.
*insertar meme de Malcom in the middle*
https://mastodon.social/@appleinsider/116357959214988006 -
Today the much anticipated version 0.9.1 of DICOM-rs is released! DICOM-rs is a Rust implementation of the DICOM standard.
The highlights are support for secure transport connections using TLS, a few API extensions, and a large number of bug fixes.
Despite being a patch release, there is a minor breaking change worth paying attention to if you use `dicom_ul` with the `async` feature. Please file an issue if you encounter some friction when updating DICOM-rs crates in your dependency tree.
https://github.com/Enet4/dicom-rs/releases/tag/v0.9.1 -
Joining in on the #fun. #xkcd #dicom https://marshdeer.github.io/xkcd2501-generator/
-
One thing I’ve never quite understood is the reluctance of certain doctors to provide medical imaging to patients in a digital format.
As someone with interests in photography, programming, data, and my own health, I find the RAW-like DICOM image file format fascinating. So, even if it comes on a CD-R and costs 2500 JPY, I always try to get my own medial imagery whenever possible. (These are also extremely helpful to have in advance if an issue recurs and you need to show the progression to a new clinic.)
I’ve had good luck getting endoscopy, X-ray, and MRI data over the years, but the doctor at the colonoscopy clinic today was a hard no. They’ll only provide the photos they took of the inside of my own body to another doctor, not to me, myself, the subject in question.
(They did provide a printout of a few key moments for my reference. Why this is available when the actual image data is not remains a mystery to me.)
#opendata #DICOM #digitalrights #patientrights #medicalimaging #japan
-
DICOM-rs 0.9.0 is here! While this one was mainly focused on introducing necessary API changes, some new features are worth highlighting: reading and writing deflated datasets, adjustments to data set writing for reliability, an improved upper layer protocol stack, and a new DICOM object trait which works for different types of objects.
-
Philips announces digital pathology scanner with native DICOM JPEG XL output
#HackerNews #Philips #DigitalPathology #DICOM #JPEGXL #MedicalTechnology #HealthcareInnovation
-
Just released DICOM-rs 0.8.2! DICOM-rs is an ecosystem of DICOM libraries and tools for the next generation of medical imaging systems.
This new revision brings a wide array of backward-compatible contributions. A major release is already in the works as we pave the way for v0.9.0, but until then, version 0.8.2 already offers some interesting features, including a new API to read DICOM data in small parts, and several improvements to pixel data decoding.
-
PACS и ИИ: от внедрения до интеграции машинного обучения в российском здравоохранении
PACS (Picture Archiving and Communication System) — это не просто софт. Это нервная система медицинской визуализации, которая собирает, архивирует и распределяет DICOM-данные между всеми участниками медицинского процесса. А внедрение PACS в реальном здравоохранении — это смесь инженерии, логистики, дипломатии и кризис-менеджмента. Представьте, что вы врач-радиолог. Каждый день вы просматриваете сотни медицинских изображений, ища признаки заболеваний, травм или аномалий. Но как эти изображения попадают к вам? Как они сохраняются и передаются между больницами? Ответ кроется в стандарте DICOM и системе PACS. DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) — это не просто формат файлов, это целая экосистема для медицинской визуализации. Представьте его как универсальный язык, на котором говорят все медицинские устройства: от рентгеновских аппаратов до МРТ-сканеров. Каждый DICOM файл — это не просто картинка, а целая история пациента, закодированная в цифровом виде. Когда пациент проходит обследование, оборудование создает не только само изображение, но и записывает массу дополнительной информации: кто пациент, когда проводилось исследование, на каком оборудовании, с какими настройками. Все это упаковывается в DICOM файл вместе с пиксельными данными. Получается своеобразная медицинская капсула времени — полная картина того, что происходило в момент исследования. Когда мы говорим об интеграции машинного обучения в медицинскую диагностику, PACS становится естественной точкой входа для ИИ-алгоритмов. В этой статье я расскажу о практическом опыте внедрения PACS в масштабах, сопоставимых с федеральным проектом, и о том, как мы интегрировали ИИ-диагностику в эту систему.
https://habr.com/ru/articles/930336/
#pacs #медицина_будущего #визуализация #машинное_обучение #dicom
-
Orthanc 1.12.7 and its Whole-Slide Imaging plugin 3.2 are now available! These maintenance updates include multiple improvements. See the full release notes for details: https://discourse.orthanc-server.org/t/whole-slide-imaging-plugin-3-2/ #DICOM
-
Standard #dicom : mi domando come sia possibile che nel 2025 quando vai a fare una #radiografia o #risonanza come referto immagine diano ancora I DVD/CD !
Basterebbe inviare o rendere disponibile al paziente su fascicolo cloud et similia il file dicom completo, sono 200/300 MB al massimo
Il 99% delle persone, compresi molti medici e strutture, non ha più i lettori DVD/CD e si inquina a stampare ancora supporti ottici per queste cose, invece di default ancora vanno col supporto fisico
-
🟠️ Nouvel article sur le blog !
Et voici la suite (et fin) de mon article sur DICOM, le format d'imagerie médicale. Après un premier article plutôt théorique, cette fois-ci on passe à la pratique : on va voir comment construire un fichier DICOM de A à Z ! 😎️
-
DICOM-rs v0.8.1 is released! DICOM-rs is an implementation of the DICOM standard for the next generation of medical imaging systems.
This is a minor milestone to deliver a significant number of patches and improvements. See the full changelog below.👇
https://github.com/Enet4/dicom-rs/releases/tag/v0.8.1 -
Tic-TAC aka CVE-2024-42845, a Remote Code Execution vulnerability inside Open Source Medical Tools when a new DICOM file is imported.
Deetz: https://www.partywave.site/show/research/Tic%20TAC%20-%20Beware%20of%20your%20scan
-
Today we bring to light DICOM-rs version 0.8.0! DICOM-rs is an implementation of the DICOM standard for the next generation of medical imaging systems.
This is a major release boasting an ample collection of new capabilities. Highlights are async support for network applications, and support for a bunch of new transfer syntaxes, including the brand new JPEG XL!
-
🆕 blog! “Opening Compact File Set (CFS) files in Linux”
I was sent some medical images in a password-protected CFS file. Here's how to open them in Linux. You can't. OK, that's a bit of an exaggeration. It's complex, but here's how to do it. The Linux software for the Compact File Set hasn't been updated in years and only works with ancient versions of […]
👀 Read more: https://shkspr.mobi/blog/2024/10/opening-compact-file-set-cfs-files-in-linux/
⸻
#DICOM #linux -
Opening Compact File Set (CFS) files in Linux
https://shkspr.mobi/blog/2024/10/opening-compact-file-set-cfs-files-in-linux/I was sent some medical images in a password-protected CFS file. Here's how to open them in Linux.
You can't.
OK, that's a bit of an exaggeration. It's complex, but here's how to do it.
The Linux software for the Compact File Set hasn't been updated in years and only works with ancient versions of Linux. Here's how to temporarily install an old version, install the software, and then liberate your files.
- Install VirtualBox or your favourite Virtual Machine.
- Install Ubuntu 18.04.6 LTS (Bionic Beaver)
- Once you're in Ubuntu, run
sudo apt install make gcc - Download the Pismo File System Redirector build 23X for Linux.
- Run
chmod +x fsr-23X-lin.run - Extract it with
runstub_folder=. ./fsr-23X-lin.run - Go into the folder it created
cd fsr-23X-lin/ - Install with
sudo ./fsrcmd install - Go back to the location where you downloaded the files
cd .. - Downloand the Pismo File Mount build 23X
- Run
chmod +x pfm-23X-lin.run - Run
sudo ./pfm-23X-lin.run install - Mount the file with
pfm mount YourFile.cfs - Type the file's password (not your login password)
- Open your file explorer, you should see the folder mounted with the files ready to copy off.
If that doesn't work, there is an alternative.
- Download an install Pismo File Mount build 23X as above.
- That installs a helper app called
ptcfs - Run
ptcfs extract YourFile.cfsand all the contents should be unpacked.
Thanks to the NHS for supplying my medical files free of charge. But why did they have to use this weird and non-standard file format? Luckily the medical images are in DICOM format, so I can 3D print my brains.
https://shkspr.mobi/blog/2024/10/opening-compact-file-set-cfs-files-in-linux/
-
@at69 Leider hinken #NextcloudNews und der #DICOM Viewer regelmäßig hinterher. Macht aber keine wirklichen Probleme und, ja... schnurrt unter PHP 8.3.x auch bei mir wie'n Kätzzgen. :wink: -
Bon. J'ai un serveur #DICOM qui tourne, et je connecte #3DSlicer dessus. Maintenant, go tester la suite d'@[email protected] (#LibreDataHub)
Raaah si j'avais eu ça il y a 20 ans en arrière ! #CétaitPasSiMieuxAvant
#fedimed #mastomed -
Support for segmentations and PET/CT is just around the corner! 📢
-
Just released DICOM-rs version 0.7.1! 🚀 DICOM-rs is an implementation of the DICOM standard for the next generation of medical imaging systems.
This release comes primarily with several bug fixes, but a few new features were added as well.
Announcement page: https://github.com/Enet4/dicom-rs/releases/tag/v0.7.1
