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229 results for “olangella”
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Current status of the #proteobench QExactive DDA module, shown yesterday https://fosstodon.org/@olangella/114715175521848642
i2MassChroQ has very good performances and a very low level of missing values
https://proteobench.cubimed.rub.de/Quant_LFQ_DDA_ion_QExactive
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Mitchum a un rôle à contre-emploi formidable, mais entre Mitchum et David Lean ça se passe mal. Lean n’ose pas dire à Mitchum ce qui ne va pas, Mitchum n’aime pas Lean et ne lui parle pas. C’est Sarah Miles qui fait la navette. Ils ont chacun leur caravane. Quand Lean veut dire un truc à Mitchum, il le dit à Miles qui le dit ensuite à Mitchum.
Pour les séquences sur la plage, il faut souvent attendre que la marée soit à un niveau particulier. Dans une séquence où il est en chemise de nuit sur la plage, Mitchum en a marre d’attendre. La caméra est très basse, en contre-plongée. Mitchum pisse sur la caméra.
/4
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Des Plantes et des Hommes en visite à GQE-Le Moulon
Retour sur les visites de classes de lycée de février et mars 2025. Au programme des rencontres avec chercheurs et ITA, des jeux, des ateliers, beaucoup d'échanges
➡️ https://moulon.inrae.fr/news/2025/05/des-plantes-et-des-hommes-en-visite-%C3%A0-gqe-le-moulon/
#sps #mediation #plantes #meiose #biologiemoleculaire #pappso #proteome @olangella
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Des Plantes et des Hommes en visite à GQE-Le Moulon
Retour sur les visites de classes de lycée de février et mars 2025. Au programme des rencontres avec chercheurs et ITA, des jeux, des ateliers, beaucoup d'échanges
➡️ https://moulon.inrae.fr/news/2025/05/des-plantes-et-des-hommes-en-visite-%C3%A0-gqe-le-moulon/
#sps #mediation #plantes #meiose #biologiemoleculaire #pappso #proteome @olangella
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Des Plantes et des Hommes en visite à GQE-Le Moulon
Retour sur les visites de classes de lycée de février et mars 2025. Au programme des rencontres avec chercheurs et ITA, des jeux, des ateliers, beaucoup d'échanges
➡️ https://moulon.inrae.fr/news/2025/05/des-plantes-et-des-hommes-en-visite-%C3%A0-gqe-le-moulon/
#sps #mediation #plantes #meiose #biologiemoleculaire #pappso #proteome @olangella
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Excellente émission présentant le travail de Rachel Carson. C'est vraiment passionnant, très bien présenté. Merci #franceinter !
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L'excellent séminaire de Nicolas Chevassus-au-Louis :
“Décroiscience : les limites à l’accumulation du savoir dans un monde fini”est en ligne
#IDEEV
#universiteparissaclay -
Hello #Proteomics !
Thinking about a better mzML to store proteomics data, but not convinced by the #parquet approach, I've converted it into #CBOR :
* Smaller data files (only 66% of the mzML original file) for the exact same data
* Faster to read (25s for a big mzML vs 18s in mzcbor on the same computer)
* Very quick random access to spectra (24.6577 ms for mzML vs 786.731 μs for mzcbor for the same operation using index)I'd like to share it if you are interested at #eubIC #eubic2026
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a new @typst template for slide presentations is available at https://typst.app/?q=gqe&template=gqe-lemoulon-presentation&version=0.0.5
It was developed for #HCERES in our lab #GQE at #IDEEV, but it is suitable for anyone as everything can be customized.
a bit of documentation here :
https://forgemia.inra.fr/gqe-moulon/gqe-presentation -
J'ai trouvé l'audition du sénat concernant la commande publique en préparation à l'ENS #saclay #UniversiteParisSaclay pour passer à Microsoft 365 très intéressante.
C'est rassurant de constater que le problème est pris au sérieux (ça pourrait être pire et passer complètement inaperçu).
J'attends donc la solution parfaite qui est en cours d'évaluation ;)En attendant, utilisez les outils de la @numerique_gouv @etalab @datagouvfr
https://videos.senat.fr/video.5402498_682cb47164330.commande-publique--ens-paris-saclay
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#StandUpForScience #UniversiteParisSaclay
#IDEEV
@lemoulonSciences and academic freedom: where are we?
https://www.ideev.universite-paris-saclay.fr/en/news/2025/04/stand-up-for-science-paris-saclay/
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#StandUpForScience à l'#UniversiteParisSaclay Mardi 8 avril, amphi A2, b.625, plateau Moulon
et Jeudi 10 avril, amphi H1, b.334, campus vallée de 12h30 à 13h30Les liens utiles ici :
https://www.ideev.universite-paris-saclay.fr/orph/standup/ -
Great talk yesterday by Thierry Balliau !
He presented our MCQR R package to do statistics on #proteomics data -
Témoignage de Lucas Jacquier, étudiant à l'#IDEEV :
Pourquoi s'investir dans le mouvement #StandUpForScience ? -
Stand-up for science : s'organiser
#StandUpForScience continue à #UniversiteParisSaclay .
Vous pouvez lire ici quelques actualités.
Nous avons aussi déposé les vidéos des interventions des 8 et 10 avril dernier sur notre chaine Peertube (https://peertube.moulon.inrae.fr/c/standupforscience_paris_sud/videos l'instance n'est pas encore fédérée)https://www.ideev.universite-paris-saclay.fr/news/2025/04/stand-up-for-science-sorganiser/
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#StandUpForScience #UniversiteParisSaclay !
Le premier amphi de mardi était super intéressant, ne manquez pas le second demain 10 avril 2025 :
➡️ 12h30-13h30, amphi H1 du bâtiment 334 dans la vallée.La science est attaquée en France aussi : ADEME, OFB, Haut conseil pour le climat, Nouvelle Loi d’orientation agricole caviardée, ZFE...
C'est gravissime et ça nous concerne tous. Rejoignez nous, le repouet donne force et santé.https://www.ideev.universite-paris-saclay.fr/news/2025/04/stand-up-for-science-paris-saclay/
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Un retour des activités de l'#IDEEV à la #fetedelascience 2024 est en ligne.
Vous y trouverez un montage video présentant les différents stands. -
#EUPA 2025 in #saintmalo is finished !
It was really great, thanks to the organisers ! -
Thanks for the presentation of the #proteobench work by Marie Locard-Pollet yesterday !
@pappso is involved in this work
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#EUPA 2025 opening session, great program, great city #saintmalo
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Arriver en train à St-Malo avec son Strida pour filer à la plage :)... avant #EUPA 2025
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Hello #proteomics,
see you soon at #EUPA 2025 meeting next week in #saintmalo .
@pappso will be there with many posters and short coms.
stay tuned ;)
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Le juge Guillou (Cour Pénale Internationale) explique pourquoi et comment il a été sanctionné par les états unis :
C'est Kafkaien...
Merci @HenriVerdier pour le lien
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i2MassChroQ 1.0.23 is out !
It comes with full support for the Sage identification software, an easy GUI to filter results on PSM and protein FDR.
It also includes MCQR 1.0.1 for post quantification statistical analysis (article submitted).
#debian packages available along with Windows version. -
@coucoulesplantes alors attention, ça manque de poésie.
Un échantillon de plante, ça nous donne plusieurs gigagoctets de données. Ce sont des listes de masses et d'intensité.
En fouillant là dedans, on peut trouver les empreintes de peptides (des morceaux de protéines).
Si on visualise ces données... voir post suivant ;)https://fr.wikipedia.org/wiki/Prot%C3%A9omique
#proteomique
#PAPPSO -
The #proteobench project from #eubic is evolving fast.
There are new results available online for the DDA module.
We present our results for i2MassChroQ #PAPPSO compared to other workflows in #proteomics :
http://pappso.inrae.fr/en/news/2024/12/i2masschroq-results-in-proteobench
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I've uploaded a new result file in #ProteoBench from @EuBIC_MS
The new results shows how #PAPPSO i2MassChroQ performs compared to other software on the same dataset.
This time, DDA quantification was made without match between run. We can see more features than using MaxQuant+Andromeda with match between run. incredible.
https://proteobench.cubimed.rub.de/DDA%20Quant%20Ion%20Level%20-BETA-
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A new version of the #proteomics software suite [i2MassChroQ](http://pappso.inrae.fr/bioinfo/i2masschroq/) is available on the #PAPPSO website.
There is a complete support for the SAGE identification engine json files.